Marża w podatku VAT, zgodnie z przepisami, to różnica między kwotą, którą płaci nabywca towarów lub usług, a ceną zakupu, pomniejszoną o podatek. Innymi słowy, sprzedawca odprowadza VAT jedynie od marży, czyli zysku, jaki uzyskuje ze sprzedaży. W tej sytuacji nie ma możliwości odliczenia VAT z faktury zakupu. Chociaż na fakturze VAT marża nie jest uwzględniona kwota podatku, sprzedawca wciąż musi ją obliczyć i wpłacić do urzędu skarbowego. Faktura VAT marża to atrakcyjne rozwiązanie dla sprzedawców. Standardowo VAT nalicza się od pełnej wartości sprzedanych towarów lub usług, jednak w przypadku faktury VAT marża opodatkowaniu podlega tylko marża, czyli prowizja sprzedawcy. Dzięki temu sprzedawca płaci do urzędu skarbowego niższy podatek VAT. W ustawie o VAT zawarte są szczegółowe zasady dotyczące korzystania z faktury VAT marża oraz wskazujące, jakie transakcje można opodatkować w tym systemie.